Zinc in the structure of Solution Structures Of the C2H2 Type Zinc Finger Domain of Human Zinc Finger Protein 24 (pdb 1x6e)
The binding sites of Zinc atom in the structure of Solution Structures Of the C2H2 Type Zinc Finger Domain of Human Zinc Finger Protein 24 (pdb code 1x6e). This binding sites where shown with 5.0 Angstroms radius around Zinc atom. The 1x6e structure was solved by M.SATO, T.TOMIZAWA, S.KOSHIBA, M.INOUE, T.KIGAWA, S.YOKOYAMA, RIKEN STRUCTURAL GENOMICS/PROTEOMICS INITIATIVE (RSGI), with NMR in Solution technique. |
Zinc Binding Sites:Zinc binding site 1 out of 2 in 1x6e
|  Click to enlarge |  Click to enlarge | Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 1 of Zinc in the PDB 1x6e. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Zinc atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Cys17, A: Val18, A: Glu19, A: Cys20, A: Gly21, A: Lys22, A: Phe24, A: His33, A: Gln34, A: His37, A: Gly16, A: Cys17, A: Val18, A: Glu19, A: Cys20, A: Gly21, A: Lys22, A: Ala23, A: Phe24, A: Leu30, A: His33, A: Val18, A: Leu30, A: Val31, A: Gln34, A: Gly16, A: Cys17, A: Val18, A: Leu30, A: Gln34, A: Tyr15, A: Gly16, A: Cys17, A: Gly21, A: Lys22, A: Ala23, A: Phe24, A: Leu30, A: Tyr15, A: Gly16, A: Cys17, A: Gly21, A: Lys22, A: Ala23, A: Phe24, A: Leu30, A: Cys17, A: Val18, A: Glu19, A: Cys20, A: Gly21, A: Leu30, A: His33, A: Gln34, A: His37, A: Gly16, A: Cys17, A: Cys20, A: Gly21, A: Lys22, A: Ala23, A: Phe24, A: Leu30, A: His33, A: Cys17, A: Val18, A: Glu19, A: Leu30, A: Gln34, A: Cys17, A: Val18, A: Glu19, A: Cys20, A: Gly21, A: Lys22, A: Phe24, A: Leu30, A: His33, A: Gln34, A: His37, A: Cys17, A: Val18, A: Glu19, A: Leu30, A: His33, A: Gln34, A: His37, A: Tyr15, A: Gly16, A: Cys17, A: Val18, A: Gly21, A: Lys22, A: Ala23, A: Leu30, A: Lys13, A: Tyr15, A: Gly16, A: Lys22, A: Ala23, A: Phe24, A: Ser25, A: Lys13, A: Pro14, A: Tyr15, A: Gly16, A: Ala23, A: Phe24, A: Ser25, A: Arg26, A: Cys17, A: Val18, A: Leu30, A: Val31, A: Gln34, A: Tyr15, A: Gly16, A: Cys17, A: Val18, A: Lys22, A: Ala23, A: Leu30, A: Cys17, A: Val18, A: Glu19, A: Leu30, A: Val31, A: Gln34, A: His37, A: Cys17, A: Glu19, A: Cys20, A: Gly21, A: Lys22, A: Phe24, A: His33, A: His37, A: Tyr15, A: Leu30, A: Val31, A: Gln34, A: Cys17, A: Val18, A: Glu19, A: Leu30, A: His33, A: Gln34, A: His37, | conact list:
Atom | Atom | Distance (A) | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | HB2 A:Glu19 | 2.75 | Zn | N A:Glu19 | 4.43 | Zn | HG3 A:Glu19 | 4.41 | Zn | CB A:Glu19 | 3.81 | Zn | HB3 A:Glu19 | 4.29 | Zn | C A:Glu19 | 4.22 | Zn | CG A:Glu19 | 4.67 | Zn | CA A:Glu19 | 4.38 | Zn | HG2 A:Glu19 | 4.95 | Zn | H A:Glu19 | 4.14 | Zn | HB2 A:Cys20 | 4.38 | Zn | N A:Cys20 | 3.46 | Zn | CB A:Cys20 | 3.45 | Zn | HB3 A:Cys20 | 3.41 | Zn | HA A:Cys20 | 4.94 | Zn | SG A:Cys20 | 2.36 | Zn | H A:Cys20 | 2.92 | Zn | C A:Cys20 | 4.68 | Zn | CA A:Cys20 | 4.02 | Zn | N A:Gly21 | 4.23 | Zn | H A:Gly21 | 3.35 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HE2 A:Phe24 | 4.64 | Zn | CD2 A:His33 | 3.02 | Zn | C A:His33 | 4.86 | Zn | CG A:His33 | 4.16 | Zn | HD2 A:His33 | 3.10 | Zn | O A:His33 | 4.01 | Zn | NE2 A:His33 | 2.36 | Zn | HE1 A:His33 | 3.76 | Zn | ND1 A:His33 | 4.30 | Zn | CE1 A:His33 | 3.37 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | CD2 A:His37 | 3.29 | Zn | CG A:His37 | 4.41 | Zn | HD2 A:His37 | 3.48 | Zn | NE2 A:His37 | 2.36 | Zn | HE1 A:His37 | 3.52 | Zn | ND1 A:His37 | 4.39 | Zn | CE1 A:His37 | 3.30 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | HB2 A:Glu19 | 2.75 | Zn | N A:Glu19 | 4.43 | Zn | HG3 A:Glu19 | 4.41 | Zn | CB A:Glu19 | 3.81 | Zn | HB3 A:Glu19 | 4.29 | Zn | C A:Glu19 | 4.22 | Zn | CG A:Glu19 | 4.67 | Zn | CA A:Glu19 | 4.38 | Zn | HG2 A:Glu19 | 4.95 | Zn | H A:Glu19 | 4.14 | Zn | HB2 A:Cys20 | 4.38 | Zn | N A:Cys20 | 3.46 | Zn | CB A:Cys20 | 3.45 | Zn | HB3 A:Cys20 | 3.41 | Zn | HA A:Cys20 | 4.94 | Zn | SG A:Cys20 | 2.36 | Zn | H A:Cys20 | 2.92 | Zn | C A:Cys20 | 4.68 | Zn | CA A:Cys20 | 4.02 | Zn | N A:Gly21 | 4.23 | Zn | H A:Gly21 | 3.35 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HE2 A:Phe24 | 4.64 | Zn | CD2 A:His33 | 3.02 | Zn | C A:His33 | 4.86 | Zn | CG A:His33 | 4.16 | Zn | HD2 A:His33 | 3.10 | Zn | O A:His33 | 4.01 | Zn | NE2 A:His33 | 2.36 | Zn | HE1 A:His33 | 3.76 | Zn | ND1 A:His33 | 4.30 | Zn | CE1 A:His33 | 3.37 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | N A:Gly21 | 4.23 | Zn | H A:Gly21 | 3.35 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HE2 A:Phe24 | 4.64 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | N A:Gly21 | 4.23 | Zn | H A:Gly21 | 3.35 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HE2 A:Phe24 | 4.64 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | HB2 A:Glu19 | 2.75 | Zn | N A:Glu19 | 4.43 | Zn | HG3 A:Glu19 | 4.41 | Zn | CB A:Glu19 | 3.81 | Zn | HB3 A:Glu19 | 4.29 | Zn | C A:Glu19 | 4.22 | Zn | CG A:Glu19 | 4.67 | Zn | CA A:Glu19 | 4.38 | Zn | HG2 A:Glu19 | 4.95 | Zn | H A:Glu19 | 4.14 | Zn | HB2 A:Cys20 | 4.38 | Zn | N A:Cys20 | 3.46 | Zn | CB A:Cys20 | 3.45 | Zn | HB3 A:Cys20 | 3.41 | Zn | HA A:Cys20 | 4.94 | Zn | SG A:Cys20 | 2.36 | Zn | H A:Cys20 | 2.92 | Zn | C A:Cys20 | 4.68 | Zn | CA A:Cys20 | 4.02 | Zn | N A:Gly21 | 4.23 | Zn | H A:Gly21 | 3.35 | Zn | CD2 A:His33 | 3.02 | Zn | C A:His33 | 4.86 | Zn | CG A:His33 | 4.16 | Zn | HD2 A:His33 | 3.10 | Zn | O A:His33 | 4.01 | Zn | NE2 A:His33 | 2.36 | Zn | HE1 A:His33 | 3.76 | Zn | ND1 A:His33 | 4.30 | Zn | CE1 A:His33 | 3.37 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | CD2 A:His37 | 3.29 | Zn | CG A:His37 | 4.41 | Zn | HD2 A:His37 | 3.48 | Zn | NE2 A:His37 | 2.36 | Zn | HE1 A:His37 | 3.52 | Zn | ND1 A:His37 | 4.39 | Zn | CE1 A:His37 | 3.30 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | HB2 A:Cys20 | 4.38 | Zn | N A:Cys20 | 3.46 | Zn | CB A:Cys20 | 3.45 | Zn | HB3 A:Cys20 | 3.41 | Zn | HA A:Cys20 | 4.94 | Zn | SG A:Cys20 | 2.36 | Zn | H A:Cys20 | 2.92 | Zn | C A:Cys20 | 4.68 | Zn | CA A:Cys20 | 4.02 | Zn | N A:Gly21 | 4.23 | Zn | H A:Gly21 | 3.35 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HE2 A:Phe24 | 4.64 | Zn | CD2 A:His33 | 3.02 | Zn | C A:His33 | 4.86 | Zn | CG A:His33 | 4.16 | Zn | HD2 A:His33 | 3.10 | Zn | O A:His33 | 4.01 | Zn | NE2 A:His33 | 2.36 | Zn | HE1 A:His33 | 3.76 | Zn | ND1 A:His33 | 4.30 | Zn | CE1 A:His33 | 3.37 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | HB2 A:Glu19 | 2.75 | Zn | N A:Glu19 | 4.43 | Zn | HG3 A:Glu19 | 4.41 | Zn | CB A:Glu19 | 3.81 | Zn | HB3 A:Glu19 | 4.29 | Zn | C A:Glu19 | 4.22 | Zn | CG A:Glu19 | 4.67 | Zn | CA A:Glu19 | 4.38 | Zn | HG2 A:Glu19 | 4.95 | Zn | H A:Glu19 | 4.14 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | HB2 A:Glu19 | 2.75 | Zn | N A:Glu19 | 4.43 | Zn | HG3 A:Glu19 | 4.41 | Zn | CB A:Glu19 | 3.81 | Zn | HB3 A:Glu19 | 4.29 | Zn | C A:Glu19 | 4.22 | Zn | CG A:Glu19 | 4.67 | Zn | CA A:Glu19 | 4.38 | Zn | HG2 A:Glu19 | 4.95 | Zn | H A:Glu19 | 4.14 | Zn | HB2 A:Cys20 | 4.38 | Zn | N A:Cys20 | 3.46 | Zn | CB A:Cys20 | 3.45 | Zn | HB3 A:Cys20 | 3.41 | Zn | HA A:Cys20 | 4.94 | Zn | SG A:Cys20 | 2.36 | Zn | H A:Cys20 | 2.92 | Zn | C A:Cys20 | 4.68 | Zn | CA A:Cys20 | 4.02 | Zn | N A:Gly21 | 4.23 | Zn | H A:Gly21 | 3.35 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HE2 A:Phe24 | 4.64 | Zn | CD2 A:His33 | 3.02 | Zn | C A:His33 | 4.86 | Zn | CG A:His33 | 4.16 | Zn | HD2 A:His33 | 3.10 | Zn | O A:His33 | 4.01 | Zn | NE2 A:His33 | 2.36 | Zn | HE1 A:His33 | 3.76 | Zn | ND1 A:His33 | 4.30 | Zn | CE1 A:His33 | 3.37 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | CD2 A:His37 | 3.29 | Zn | CG A:His37 | 4.41 | Zn | HD2 A:His37 | 3.48 | Zn | NE2 A:His37 | 2.36 | Zn | HE1 A:His37 | 3.52 | Zn | ND1 A:His37 | 4.39 | Zn | CE1 A:His37 | 3.30 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | HB2 A:Glu19 | 2.75 | Zn | N A:Glu19 | 4.43 | Zn | HG3 A:Glu19 | 4.41 | Zn | CB A:Glu19 | 3.81 | Zn | HB3 A:Glu19 | 4.29 | Zn | C A:Glu19 | 4.22 | Zn | CG A:Glu19 | 4.67 | Zn | CA A:Glu19 | 4.38 | Zn | HG2 A:Glu19 | 4.95 | Zn | H A:Glu19 | 4.14 | Zn | CD2 A:His33 | 3.02 | Zn | C A:His33 | 4.86 | Zn | CG A:His33 | 4.16 | Zn | HD2 A:His33 | 3.10 | Zn | O A:His33 | 4.01 | Zn | NE2 A:His33 | 2.36 | Zn | HE1 A:His33 | 3.76 | Zn | ND1 A:His33 | 4.30 | Zn | CE1 A:His33 | 3.37 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | CD2 A:His37 | 3.29 | Zn | CG A:His37 | 4.41 | Zn | HD2 A:His37 | 3.48 | Zn | NE2 A:His37 | 2.36 | Zn | HE1 A:His37 | 3.52 | Zn | ND1 A:His37 | 4.39 | Zn | CE1 A:His37 | 3.30 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | N A:Gly21 | 4.23 | Zn | H A:Gly21 | 3.35 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HE2 A:Phe24 | 4.64 | Zn | HE2 A:Phe24 | 4.64 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | HB2 A:Glu19 | 2.75 | Zn | N A:Glu19 | 4.43 | Zn | HG3 A:Glu19 | 4.41 | Zn | CB A:Glu19 | 3.81 | Zn | HB3 A:Glu19 | 4.29 | Zn | C A:Glu19 | 4.22 | Zn | CG A:Glu19 | 4.67 | Zn | CA A:Glu19 | 4.38 | Zn | HG2 A:Glu19 | 4.95 | Zn | H A:Glu19 | 4.14 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | CD2 A:His37 | 3.29 | Zn | CG A:His37 | 4.41 | Zn | HD2 A:His37 | 3.48 | Zn | NE2 A:His37 | 2.36 | Zn | HE1 A:His37 | 3.52 | Zn | ND1 A:His37 | 4.39 | Zn | CE1 A:His37 | 3.30 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | HB2 A:Glu19 | 2.75 | Zn | N A:Glu19 | 4.43 | Zn | HG3 A:Glu19 | 4.41 | Zn | CB A:Glu19 | 3.81 | Zn | HB3 A:Glu19 | 4.29 | Zn | C A:Glu19 | 4.22 | Zn | CG A:Glu19 | 4.67 | Zn | CA A:Glu19 | 4.38 | Zn | HG2 A:Glu19 | 4.95 | Zn | H A:Glu19 | 4.14 | Zn | HB2 A:Cys20 | 4.38 | Zn | N A:Cys20 | 3.46 | Zn | CB A:Cys20 | 3.45 | Zn | HB3 A:Cys20 | 3.41 | Zn | HA A:Cys20 | 4.94 | Zn | SG A:Cys20 | 2.36 | Zn | H A:Cys20 | 2.92 | Zn | C A:Cys20 | 4.68 | Zn | CA A:Cys20 | 4.02 | Zn | N A:Gly21 | 4.23 | Zn | H A:Gly21 | 3.35 | Zn | HB2 A:Lys22 | 3.43 | Zn | N A:Lys22 | 4.51 | Zn | HG3 A:Lys22 | 4.17 | Zn | CB A:Lys22 | 4.43 | Zn | CG A:Lys22 | 4.71 | Zn | HG2 A:Lys22 | 4.81 | Zn | H A:Lys22 | 3.57 | Zn | HE2 A:Phe24 | 4.64 | Zn | CD2 A:His33 | 3.02 | Zn | C A:His33 | 4.86 | Zn | CG A:His33 | 4.16 | Zn | HD2 A:His33 | 3.10 | Zn | O A:His33 | 4.01 | Zn | NE2 A:His33 | 2.36 | Zn | HE1 A:His33 | 3.76 | Zn | ND1 A:His33 | 4.30 | Zn | CE1 A:His33 | 3.37 | Zn | CD2 A:His37 | 3.29 | Zn | CG A:His37 | 4.41 | Zn | HD2 A:His37 | 3.48 | Zn | NE2 A:His37 | 2.36 | Zn | HE1 A:His37 | 3.52 | Zn | ND1 A:His37 | 4.39 | Zn | CE1 A:His37 | 3.30 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | HB2 A:Cys17 | 3.55 | Zn | CB A:Cys17 | 3.31 | Zn | HB3 A:Cys17 | 3.17 | Zn | SG A:Cys17 | 2.37 | Zn | CA A:Cys17 | 4.73 | Zn | H A:Val18 | 4.85 | Zn | HB2 A:Glu19 | 2.75 | Zn | N A:Glu19 | 4.43 | Zn | HG3 A:Glu19 | 4.41 | Zn | CB A:Glu19 | 3.81 | Zn | HB3 A:Glu19 | 4.29 | Zn | C A:Glu19 | 4.22 | Zn | CG A:Glu19 | 4.67 | Zn | CA A:Glu19 | 4.38 | Zn | HG2 A:Glu19 | 4.95 | Zn | H A:Glu19 | 4.14 | Zn | CD2 A:His33 | 3.02 | Zn | C A:His33 | 4.86 | Zn | CG A:His33 | 4.16 | Zn | HD2 A:His33 | 3.10 | Zn | O A:His33 | 4.01 | Zn | NE2 A:His33 | 2.36 | Zn | HE1 A:His33 | 3.76 | Zn | ND1 A:His33 | 4.30 | Zn | CE1 A:His33 | 3.37 | Zn | CG A:Gln34 | 4.95 | Zn | HG2 A:Gln34 | 3.87 | Zn | HA A:Gln34 | 4.06 | Zn | CD2 A:His37 | 3.29 | Zn | CG A:His37 | 4.41 | Zn | HD2 A:His37 | 3.48 | Zn | NE2 A:His37 | 2.36 | Zn | HE1 A:His37 | 3.52 | Zn | ND1 A:His37 | 4.39 | Zn | CE1 A:His37 | 3.30 |
| interactive model:
| Zinc binding site 2 out of 2 in 1x6e
|  Click to enlarge |  Click to enlarge | Mono- and Stereo- picture of 5.0 Angstrom coordination sphere 2 of Zinc in the PDB 1x6e. Coordination sphere was calculated for all residues within 5.0 Angstroms distance from the central Zinc atom, shown by VdW sphere Residues shown as a stick model or VDW spheres: A: Cys45, A: Leu46, A: Glu47, A: Cys48, A: Gly49, A: Lys50, A: Phe52, A: His61, A: Gln62, A: His65, A: Glu47, A: Ile59, A: His61, A: Gln62, A: Arg63, A: Ile64, A: His65, A: Thr66, A: Lys50, A: Phe52, A: His61, A: Gly49, A: Lys50, A: Ala51, A: Phe52, A: His61, A: Gln54, A: Asn55, A: Ser56, A: Gly57, A: Cys45, A: Leu46, A: Glu47, A: Cys48, A: Gly49, A: His61, A: Gln62, A: His65, A: Gly57, A: Asn60, A: Ile59, A: Asn60, A: His61, A: Gln62, A: Arg63, A: Ile64, A: His65, A: Thr66, A: Ser67, A: Asn60, A: His61, A: Ile64, A: Lys50, A: Phe52, A: His61, A: Ile64, A: His65, A: Phe52, A: Asn60, A: His61, A: Glu47, A: Ile59, A: His61, A: Gln62, A: Arg63, A: Ile64, A: His65, A: Thr66, A: Leu46, A: Glu47, A: Gln62, A: Cys45, A: Leu46, A: Glu47, A: Gln62, A: Asn60, A: His61, A: Arg63, A: Ile64, A: Glu47, A: His61, A: Gln62, A: Arg63, A: Ile64, A: His65, A: Phe52, A: His61, A: Ile64, A: Gln54, A: Asn55, A: Ser56, A: Gly57, A: Ile59, A: Asn60, A: His61, A: Gln62, A: Arg63, A: Ile64, A: Asn60, | conact list:
Atom | Atom | Distance (A) | Zn | HB2 A:Cys45 | 3.55 | Zn | CB A:Cys45 | 3.47 | Zn | HB3 A:Cys45 | 3.57 | Zn | SG A:Cys45 | 2.35 | Zn | CA A:Cys45 | 4.88 | Zn | H A:Leu46 | 4.79 | Zn | HB2 A:Glu47 | 4.43 | Zn | N A:Glu47 | 4.80 | Zn | CB A:Glu47 | 4.29 | Zn | HB3 A:Glu47 | 3.34 | Zn | C A:Glu47 | 4.65 | Zn | CA A:Glu47 | 4.83 | Zn | H A:Glu47 | 4.28 | Zn | HB2 A:Cys48 | 4.41 | Zn | N A:Cys48 | 3.63 | Zn | CB A:Cys48 | 3.50 | Zn | HB3 A:Cys48 | 3.49 | Zn | SG A:Cys48 | 2.33 | Zn | H A:Cys48 | 2.84 | Zn | C A:Cys48 | 4.60 | Zn | CA A:Cys48 | 4.08 | Zn | N A:Gly49 | 4.06 | Zn | H A:Gly49 | 3.16 | Zn | HB2 A:Lys50 | 4.63 | Zn | HB3 A:Lys50 | 4.56 | Zn | HE2 A:Lys50 | 4.98 | Zn | HE1 A:Phe52 | 5.00 | Zn | HZ A:Phe52 | 4.66 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | CG A:Gln62 | 4.83 | Zn | CA A:Gln62 | 4.99 | Zn | HG2 A:Gln62 | 3.80 | Zn | HA A:Gln62 | 4.02 | Zn | CD2 A:His65 | 3.24 | Zn | CG A:His65 | 4.35 | Zn | HD2 A:His65 | 3.44 | Zn | NE2 A:His65 | 2.34 | Zn | HE1 A:His65 | 3.50 | Zn | ND1 A:His65 | 4.33 | Zn | CE1 A:His65 | 3.27 | Zn | HB2 A:Glu47 | 4.43 | Zn | N A:Glu47 | 4.80 | Zn | CB A:Glu47 | 4.29 | Zn | HB3 A:Glu47 | 3.34 | Zn | C A:Glu47 | 4.65 | Zn | CA A:Glu47 | 4.83 | Zn | H A:Glu47 | 4.28 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | CG A:Gln62 | 4.83 | Zn | CA A:Gln62 | 4.99 | Zn | HG2 A:Gln62 | 3.80 | Zn | HA A:Gln62 | 4.02 | Zn | CD2 A:His65 | 3.24 | Zn | CG A:His65 | 4.35 | Zn | HD2 A:His65 | 3.44 | Zn | NE2 A:His65 | 2.34 | Zn | HE1 A:His65 | 3.50 | Zn | ND1 A:His65 | 4.33 | Zn | CE1 A:His65 | 3.27 | Zn | HB2 A:Lys50 | 4.63 | Zn | HB3 A:Lys50 | 4.56 | Zn | HE2 A:Lys50 | 4.98 | Zn | HE1 A:Phe52 | 5.00 | Zn | HZ A:Phe52 | 4.66 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | N A:Gly49 | 4.06 | Zn | H A:Gly49 | 3.16 | Zn | HB2 A:Lys50 | 4.63 | Zn | HB3 A:Lys50 | 4.56 | Zn | HE2 A:Lys50 | 4.98 | Zn | HE1 A:Phe52 | 5.00 | Zn | HZ A:Phe52 | 4.66 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | HB2 A:Cys45 | 3.55 | Zn | CB A:Cys45 | 3.47 | Zn | HB3 A:Cys45 | 3.57 | Zn | SG A:Cys45 | 2.35 | Zn | CA A:Cys45 | 4.88 | Zn | H A:Leu46 | 4.79 | Zn | HB2 A:Glu47 | 4.43 | Zn | N A:Glu47 | 4.80 | Zn | CB A:Glu47 | 4.29 | Zn | HB3 A:Glu47 | 3.34 | Zn | C A:Glu47 | 4.65 | Zn | CA A:Glu47 | 4.83 | Zn | H A:Glu47 | 4.28 | Zn | HB2 A:Cys48 | 4.41 | Zn | N A:Cys48 | 3.63 | Zn | CB A:Cys48 | 3.50 | Zn | HB3 A:Cys48 | 3.49 | Zn | SG A:Cys48 | 2.33 | Zn | H A:Cys48 | 2.84 | Zn | C A:Cys48 | 4.60 | Zn | CA A:Cys48 | 4.08 | Zn | N A:Gly49 | 4.06 | Zn | H A:Gly49 | 3.16 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | CG A:Gln62 | 4.83 | Zn | CA A:Gln62 | 4.99 | Zn | HG2 A:Gln62 | 3.80 | Zn | HA A:Gln62 | 4.02 | Zn | CD2 A:His65 | 3.24 | Zn | CG A:His65 | 4.35 | Zn | HD2 A:His65 | 3.44 | Zn | NE2 A:His65 | 2.34 | Zn | HE1 A:His65 | 3.50 | Zn | ND1 A:His65 | 4.33 | Zn | CE1 A:His65 | 3.27 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | CG A:Gln62 | 4.83 | Zn | CA A:Gln62 | 4.99 | Zn | HG2 A:Gln62 | 3.80 | Zn | HA A:Gln62 | 4.02 | Zn | CD2 A:His65 | 3.24 | Zn | CG A:His65 | 4.35 | Zn | HD2 A:His65 | 3.44 | Zn | NE2 A:His65 | 2.34 | Zn | HE1 A:His65 | 3.50 | Zn | ND1 A:His65 | 4.33 | Zn | CE1 A:His65 | 3.27 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | HB2 A:Lys50 | 4.63 | Zn | HB3 A:Lys50 | 4.56 | Zn | HE2 A:Lys50 | 4.98 | Zn | HE1 A:Phe52 | 5.00 | Zn | HZ A:Phe52 | 4.66 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | CD2 A:His65 | 3.24 | Zn | CG A:His65 | 4.35 | Zn | HD2 A:His65 | 3.44 | Zn | NE2 A:His65 | 2.34 | Zn | HE1 A:His65 | 3.50 | Zn | ND1 A:His65 | 4.33 | Zn | CE1 A:His65 | 3.27 | Zn | HE1 A:Phe52 | 5.00 | Zn | HZ A:Phe52 | 4.66 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | HB2 A:Glu47 | 4.43 | Zn | N A:Glu47 | 4.80 | Zn | CB A:Glu47 | 4.29 | Zn | HB3 A:Glu47 | 3.34 | Zn | C A:Glu47 | 4.65 | Zn | CA A:Glu47 | 4.83 | Zn | H A:Glu47 | 4.28 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | CG A:Gln62 | 4.83 | Zn | CA A:Gln62 | 4.99 | Zn | HG2 A:Gln62 | 3.80 | Zn | HA A:Gln62 | 4.02 | Zn | CD2 A:His65 | 3.24 | Zn | CG A:His65 | 4.35 | Zn | HD2 A:His65 | 3.44 | Zn | NE2 A:His65 | 2.34 | Zn | HE1 A:His65 | 3.50 | Zn | ND1 A:His65 | 4.33 | Zn | CE1 A:His65 | 3.27 | Zn | H A:Leu46 | 4.79 | Zn | HB2 A:Glu47 | 4.43 | Zn | N A:Glu47 | 4.80 | Zn | CB A:Glu47 | 4.29 | Zn | HB3 A:Glu47 | 3.34 | Zn | C A:Glu47 | 4.65 | Zn | CA A:Glu47 | 4.83 | Zn | H A:Glu47 | 4.28 | Zn | CG A:Gln62 | 4.83 | Zn | CA A:Gln62 | 4.99 | Zn | HG2 A:Gln62 | 3.80 | Zn | HA A:Gln62 | 4.02 | Zn | HB2 A:Cys45 | 3.55 | Zn | CB A:Cys45 | 3.47 | Zn | HB3 A:Cys45 | 3.57 | Zn | SG A:Cys45 | 2.35 | Zn | CA A:Cys45 | 4.88 | Zn | H A:Leu46 | 4.79 | Zn | HB2 A:Glu47 | 4.43 | Zn | N A:Glu47 | 4.80 | Zn | CB A:Glu47 | 4.29 | Zn | HB3 A:Glu47 | 3.34 | Zn | C A:Glu47 | 4.65 | Zn | CA A:Glu47 | 4.83 | Zn | H A:Glu47 | 4.28 | Zn | CG A:Gln62 | 4.83 | Zn | CA A:Gln62 | 4.99 | Zn | HG2 A:Gln62 | 3.80 | Zn | HA A:Gln62 | 4.02 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | HB2 A:Glu47 | 4.43 | Zn | N A:Glu47 | 4.80 | Zn | CB A:Glu47 | 4.29 | Zn | HB3 A:Glu47 | 3.34 | Zn | C A:Glu47 | 4.65 | Zn | CA A:Glu47 | 4.83 | Zn | H A:Glu47 | 4.28 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | CG A:Gln62 | 4.83 | Zn | CA A:Gln62 | 4.99 | Zn | HG2 A:Gln62 | 3.80 | Zn | HA A:Gln62 | 4.02 | Zn | CD2 A:His65 | 3.24 | Zn | CG A:His65 | 4.35 | Zn | HD2 A:His65 | 3.44 | Zn | NE2 A:His65 | 2.34 | Zn | HE1 A:His65 | 3.50 | Zn | ND1 A:His65 | 4.33 | Zn | CE1 A:His65 | 3.27 | Zn | HE1 A:Phe52 | 5.00 | Zn | HZ A:Phe52 | 4.66 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | CD2 A:His61 | 2.76 | Zn | C A:His61 | 4.57 | Zn | CG A:His61 | 3.95 | Zn | HD2 A:His61 | 2.69 | Zn | O A:His61 | 3.62 | Zn | NE2 A:His61 | 2.36 | Zn | HE1 A:His61 | 4.00 | Zn | ND1 A:His61 | 4.26 | Zn | CE1 A:His61 | 3.48 | Zn | CG A:Gln62 | 4.83 | Zn | CA A:Gln62 | 4.99 | Zn | HG2 A:Gln62 | 3.80 | Zn | HA A:Gln62 | 4.02 |
| interactive model:
|
|
|
|
|